
Za bržu obradu, u Hrvatskoj su postavljeni EES kiosci na šest aerodroma – Zagreb, Split, Dubrovnik, Pula, Zadar i Rijeka. Kioske mogu koristiti državljani trećih zemalja koji prvi put ulaze u šengenski prostor i nemaju kreiran dosije. Kroz kioske se obavlja predregistracija koja uključuje skeniranje putne isprave, uzimanje biometrije i kratak upitnik o razlogu dolaska. Sistem je dostupan na 15 jezika, među kojima su i srpski, hrvatski, engleski, nemački i francuski.
Elektronski sistem beleži vreme i mesto ulaska i izlaska državljana trećih zemalja koji imaju odobrenje za kratkotrajan boravak u državama članicama EU. Poređenjem prethodno unetih biometrijskih podataka i slike lica uživo pri ponovnom dolasku potvrđuje se identitet putnika. Pri izlasku iz Šengenske zone takođe se proverava identitet pomoću snimljene fotografije i putne isprave.
Kako navode hrvatske vlasti, očekuje se povećano vreme čekanja na granicama u prvim mesecima primene sistema. Međutim, nakon što većina putnika dobije kreiran EES dosije, procedure bi trebalo da se ubrzaju, čime bi se gužve postepeno smanjile.